מאז נכנסה מיכאלי לתפקידה ומינתה את מיכל פרנק, לשעבר מנכ"לית 'הקרן לידידות', למנכ"לית משרד התחבורה, מנסות השתיים לכאורה, להחליף שני מנהלי אגפים בכירים, יעקב נתניהו ושילה אדלר, שמונו בהליך מכרזי תקין במהלך כהונת הממשלה הקודמת. נתניהו משמש כראש ראשות התחבורה הציבורית ולדברי גורמים במשרד התחבורה חולל שינויים עמוקים במשרד והצליח לקדם את מערך התחבורה הציבורית בצורה ניכרת. "לא ניתן להתעלם מהעובדה ששני הבכירים חובשי כיפה ופועלים כנגד חילול שבת במערך התחבורה הציבורית ובתחום פיתוח התשתיות", אומרים גורמים במשרד לקול היהודי.
מן השדולה למען שמירת השבת, בראשות ח"כ משה אבוטבול (ש"ס), נמסר בעבר לקול היהודי בנוגע לניסיונות השרה לשינוי הסטטוס-קוו: "מבלי להזכיר כלל את המילה 'שבת', מנסה השרה להעביר מהלך שיאפשר חילול שבת המוני, תוך פגיעה קשה בצביון היהודי".
"כל כולו של המהלך נועד למטרה אחת ויחידה - לאפשר לגורמים פרטיים ולרשויות מקומיות להפעיל שירות בתשלום בשבת ובכך לדרוס את שאריות השבת במרחב הציבורי", דברי חה"כ אבוטבול.
יו"ר אגודת ישראל, ח"כ ליצמן אמר בתגובה לעיתון גלובס: "יוזמת השרה מיכאלי להפעלת תחבורה פרטית בשבתות מסוכנת ומבישה. על מפלגת ימינה להחליט האם היא לוקחת חלק בהרס הסטטוס קוו בישראל כפשוטו. מדובר בצעד מתריס ומעורר זעזוע, שיפגע קשות בשמירת השבת הציבורית בישראל. בכך ממשיכה ממשלת הזדון הרפורמית בצעדי ההרס הקשים נגד ערכי הדת".
מאיגוד המוניות נמסר לקול היהודי: "איגוד המוניות מתנגד לגביה של תשלום במזומן ללא כל תאום מקצועי. נהגי המוניות קנו את הזכות להסיע בשכר בכסף רב ולא נסכים שיפגעו לנו בזכות הזאת".
