השהות היהודית המתמשכת בחומש, הפכה מזמן לצנינים בעיני שר הבטחון אהוד ברק וצמרת הפיקוד בצה"ל. מעת לעת מפנה הצבא את היהודים הנאחזים מזה מספר שנים באדמת חומש, ברוב הפעמים – נעשה הדבר בשבת.
הפינוי האחרון תוך חילול שבת, היה לפני כשלושה שבועות, על ידי גדוד 'קדם' של פיקוד העורף, שבפיקודו עומד תושב היישוב עלי שבבנימין ובוגר המכינה. וועדת המשנה לענייני איו"ש, של וועדת החוץ והביטחון בכנסת קבעה לפני כארבע שנים, כי אין לפנות את אנשי חומש בשבת, אך נראה כי בצה"ל ובמשטרה ממשיכים לצפצף על ההחלטה.
כמו אותם חברי הכנסת, כך גם חייל בגדוד 82 של השיריון, שתפס את גיזרת חומש לפני הגדוד של פיקוד הערוף, הבין שמדובר בחילול השבת מיותר, שנכפה גם על חבריו הלוחמים שנאלצו לפנות את תושבי חומש בחוסר רצון מופגן.
הלוחם, שמילא תפקיד בחפ"ק הגדודי, נהג לקיים שיחות טלפון קבועות עם תושבי חומש בכל יום שישי בשבוע, בהן מסר להם מידע שיעזור להם להתחמק מהצבא ולשהות בחומש במהלך השבת. "החייל הבין שאם פיקוד הגדוד יחשוב שאין יהודים בחומש, הדבר יצמצם באופן משמעותי את חילול השבת, הן כלפי האזרחים והן כלפי החיילים", הסבירו לקול היהודי תושבי חומש. בשל תפקידו בחפ"ק הגדודי, ידע הלוחם להעביר מידע מדוייק לתושבי חומש, ואכן, שוב ושוב חזרו הכוחות בידיים ריקות, ללא שהצליחו לעצור איש מתושבי היישוב.
באורח מקרי נחשפה 'החפרפרת', לאחר מספר שבועות, כשבאחת הפעמים בהן התקשרו אנשי חומש לחייל בזמן שנהג בג'יפ, ומי שענה לשיחה היה מפקד הפלוגה שלו. "הסיפור היכה בהלם את הגדוד, שלא הצליח להבין איך באף מקרה לא הצליחו לגרום לחילול שבת בחומש, על אף כל האינדיקציות שהיו להם על נוכחות יהודית במקום", אמרו בחומש. בעקבות המעשה, טופל החייל משמעתית ביחידתו, ונידון לארבעה עשר ימי מחבוש.
כזכור, בית משפט השלום בכפר סבא קבע כי אין בשהות בחומש משום עבירה על החוק, ועל כן אין יכולת חוקית למנוע את שהותם של התושבים במקום. החוק שקבע כי לא יהיו נוכחים אזרחים במתחם הישובים המועמדים לפינוי, התייחס אך ורק לימים שקדמו לעקירה. השופט דוד גדול קבע כי משהושלמה תכנית ההתנתקות הרי שהחוק והענישה הכרוכה בו אינה קיימת עוד. "הפרק העונשי של חוק ההתנתקות מיצה את עצמו ואי אפשר כיום להביא חשובים לבית המשפט כשהבסיס המשפטי להבאתם הוא חוק ההתנתקות", כתב השופט גדול באחת מהפעמים בו נעצרו יהודים בשל שהייתם בחורבות חומש.
מדובר צה"ל נמסר בתגובה: "שהייה של אזרחים ישראלים באזור חומש אסורה ומהווה הפרה של חוקי המדינה. הימצאותם של אזרחים במקום כרוכה בסכנה ממשית לחייהם ולחיי כוחות הביטחון, על כן הם מפונים משם. צה"ל פועל במהלך השבת רק כאשר ישנו צורך מבצעי ממשי וחיי אדם בסכנה."
תגובת 'דובר צה"ל' 7 כ"ח אייר תשע"א 19:04 תגובת 'דובר צה"ל'
משה 6 כ"ז אייר תשע"א 15:55 משה
לעופר 5 כ"ז אייר תשע"א 12:36 לעופר
צחי 4 כ"ז אייר תשע"א 12:27 צחי
עופר 3 כ"ז אייר תשע"א 11:36 עופר
כרגיל דובר צה"ל מסלף את העובדות וחוזר על המנטרה הדבילית 2 כ"ז אייר תשע"א 07:52 כרגיל דובר צה"ל מסלף את העובדות וחוזר על המנטרה הדבילית
שמוליק 1 כ"ו אייר תשע"א 22:31 שמוליק