ראש מועצת בקעת הירדן דוד אלחיאני תוקף את מתאם פעולות הממשלה בשטחים יואב (פולי מרדכי) והמנהל האזרחי וקורא לפרק את המנהל האזרחי ולהעמיד בראש המתפ"ש אזרח ולא איש צבא.
בראיון בתכנית קלמן ליברמן ברשת ב' הציג אלחיאני מציאות בה המנהל האזרחי מקדם פעילות מתוך אג'נדה אישית וללא ידיעת הממשלה, למשל בתכנון ערבים ערביות.
"לפני שלוש שנים פניתי למנדלבליט והבאתי לידיעתו שהמנהל האזרחי ומתפ"ש מקדמים 7 תכניות מתאר לפלסטינים בבקעת הירדן. הוא היה בהלם", אמר אלחיאני. "אף אחד לא ידע במה מדובר אבל גם לאחר שהוא הוציא מכתב בשם ראש הממשלה להביא אותם לידיעת הקבינט והמתפש ממשיך לעשות את זה.
פניתי למשרד הביטחון והם עונים לי שמי שקידם את זה, ומדגישים בקו שחור, זו יוזמה פרטית של המנהל האזרחי. אני אומר אמירה קשה. מתחוללת פה הפיכה צבאית שקטה בגלל אזלת יד של המחוקקים שלנו. קיימת פה מדינה בתוך מדינה ונכנסו לחלל הזה אנשי צבא שהם אלו שקובעים לנו את החיים האזרחיים ביהודה ושומרון ובקעת הירדן. רק דוגמה אחת פשוטה. אתמול בדיון בוועדת הפנים אומר קצין בכיר מהמנהל האזרחי שהם עושים תיירות לא רע. איש צבא עושה תיירות? אם זו לא הפיכה צבאית שקטה אז מה זה? אולי הם ינהלו את המדינה?".
אלחיאני ציין כי האחריות לשינוי המצב מוטלת על המדינה. "יש גם אחריות על הצבא וגם ראש הממשלה וגם שר הביטחון, אבל הם עסוקים, והאנשים האלה במתפ"ש מנצלים את העובדה שהם עסוקים ומקדמים אג'נדה. אומרת את זה גם רונית לוין שהיתה יועמ"שית במנהל האזרחי ומתארת במאמר שלה איך היא מקדמת נושאי התיישבות באג'נדה הפרטית שלה. הם לא שואלים את מדינת ישראל".
אלחיאני הסביר כי יש לסגור את המנהל האזרחי שמלכתחילה נועד לטפל באוכלוסייה הערבית ביהודה ושומרון. "בהסכמי אוסלו נאמר, ולא בכדי, כי עם כינונה של מועצה פלסטינית יפורק המנהל האזרחי. ראש מנהל אזרחי לשעבר אמר שאסור שהמתפ"ש יהיה איש צבא. הוא עדיין אלוף בצבא ואמר את זה. אנשי צבא אין להם תפיסה אזרחית ולא מבינים את השפה בכלל. אני גר 34 שנים בבקעת הירדן ואני מכיר מציאות שהמנהל האזרחי לא היה כזה דומיננטי והתעסק אך ורק באוכלוסייה הפלסטינית. בעקבות אוסלו הם הפסיקו להתעסק עם רוב הפלסטינים. חברים וחברות תתעשתו, היום יותר שרים וחברי כנסת משתכנעים שצריך לפרק את המנהל האזרחי".