על פי כתב האישום, ביום שישי לפני קרוב לחודש, "קשרו השלושה קשר להצית ולרסס כתובות בבית הספר הדו לשוני בירושלים, בו לומדים יהודים וערבים. הדבר נעשה כחלק מפעילותם של הנאשמים כנגד התבוללות וכנגד דו קיום בין ערבים ליהודים וכן לאחר שנודע לנאשמים כי התקיים בבית הספר הדו לשוני בירושלים טקס לזכרו של יאסר עראפת מספר שבועות קודם לכן, ועל רקע הפיגועים שאירעו בעיר ירושלים ומתוך מטרה לבצע מעשה שיצור הד תקשורתי".
למחרת בערב הלכו הנאשמים ברגל לבית הספר כשהם מצויידים בבקבוקי בנזין, מצית, תרסיס הצבע ושקיות הניילון, וכשפניהם וידיהם מכוסות ונעליהם עטופות בשקיות הניילון בכדי למנוע את זיהויים והשארת תביעות נעליים. על פי כתב האישום יצחק גבאי ושלמה רחמים טויטו נכנסו לשתי כיתות דרך החלון, ושפכו דלק בכיתות. ובאותו זמן נחמן טויטו ריסס כתובות על הקיר שלשונן: "מוות לערבים", "כהנא צדק", "אין דו קיום עם סרטן" ו"די להיתבוללות".
לאחר ששלמה יצא מהחלון, הדליק יצחק גבאי אש בכיתות באמצעות המצית בה הצטייד מראש, והנאשמים נמלטו מהמקום בריצה, נכנסו לרכב ונמלטו מהמקום.
כתוצאה ממעשיהם, פרצה אש שגרמה נזק כבד לבית הספר, בין השאר לשתי כיתות, לציוד שבתוכן, לחלונות ולמערכות האזעקה וכיבוי האש בכל בית הספר. הפרקליטות מבקשת לעצור את הנאשמים עד תום ההליכים המשפטיים נגדם.
יש לציין כי השלושה נחקרו בתנאים קשים במתקן שב"כ ונאסר עליהם לפגוש עו"ד בצו השמור בדרך כלל למחבלים. בחקירתם הם נשברו והודו בביצוע המעשה.