כמו כן, ניפצו הפורעים הערבים את מיכל המים שעל גג הציון ושברו את ארון החשמל של המתחם.
זמן ארוך לאחר שהפורעים שהו במתחם והשחיתו בו כמה חדרים, הגיעו כוחות משטרה של "הרשות הפלסטינית" והוציאו את הפורעים מהמקום.
בתוך כך, במהלך הלילה על פי דיווחים ערביים, מחבלים פתחו באש אל בסיס צה"ל בהר גריזים. מתיעוד שפירסמו הערבים נראה כי הצבא העלה פצצות תאורה בניסיון לאתר את המחבלים.
לחזור לשכם
מישיבת "עוד יוסף חי" אשר פעלה במתחם הקבר עד לפרוץ האינתיפאד השניה נמסר כי "מאז נטישת המקום וגזרת הגלות שנכפתה על ישיבת "עוד יוסף חי" שלמדה במתחם הקבר במשך השנים, קבר יוסף הפך ליעד מועדף להתקפות מחבלים הרוצים להראות בעלות על הארץ. לצערינו, דווקא קבר יוסף, שהינו אחד משלושת המקומות שנקנו ע''י אבותינו ואין לאומות העולם זכות לומר "גזולים הם בידכם", נשרף ומחולל פעם אחר פעם".
"זהו מקום מבחן לבעלות העם היהודי על הארץ, ולכן התיקון צריך להיות בחזרת ישיבת "עוד יוסף חי" למקום ומגורי יהודים באופן קבוע בעיר שכם", הוסיפו בישיבה.