עשרות מתפללים שהו במהלך יום הכיפורים במתחם קבר רחל בבית לחם. השהייה במקום התאפשרה בעקבות אישור מיוחד ואבטחה של המשטרה וצה"ל במקום. בסך הכול הגיעו להתפלל ביום הקדוש ולשהות במקום כארבעים מתפללים.
בחברון גדשו המתפללים את מערת המכפלה. אולם יצחק נפתח ליהודים ובמקום התקיימו תפילות. בחברון התקיימו אירועי סליחות המוניים לנשים ולגברים בעשרת ימי תשובה. בחול המועד סוכות מתקיים במקום אירוע מרכזי של שמחת בית השואבה.
במהלך יום הכיפורים שהו אלפי יהודים גם בציון רבי שמעון בר יוחאי במירון והתפללו על קברו. מדי שנה מגיע ציבור גדול לתפילות יום הכיפורים במקום. הכנסות אורחים סיפקו לעולים אוכל ושתיה לפני ואחרי החג.