הפרסומים בקול היהודי אודות קשר אפשרי בין המסגד בו שימש אחד המחבלים כמואזין לבין הפיגוע שביצעו שלושת המחבלים מאום אל פאחם בהר הבית התבררו כנכונים, וזאת לאור הפרטים שהותרו הבוקר לפרסום לאחר חקירת השב"כ. בין השאר עולה כי המחבלים שיתפו חבר נוסף בתכנון הפיגוע, היו קשורים לפלג הצפוני של התנועה האיסלאמית והחביאו את הנשק במסגד אל פארוק/אלמלסאא באום אל פאחם.
במסגרת חקירת הפיגוע נעצר אמג'ד מחמד אחמד ג'בארין, תושב אום אל פחם בחשד למעורבותו בהקשר לפיגוע. במסגרת החקירה התבררו פרטים בנוגע לפעילות המפגעים טרם ביצוע הפיגוע, בו נרצחו שני שוטרים, כמיל שנאן והאיל סתאווי ז"ל, ונפצעו שלושה נוספים בדרגות חומרה שונות.
הפיגוע בוצע על ידי שלושת המחבלים מאום אל פחם:
מחמד אחמד מחמד ג'בארין, בן 29.
מחמד חאמד עא לטיף ג'בארין, בן 19.
מחמד אחמד מפדל ג'בארין, בן 18.
ממצאי חקירת הפיגוע העלו כי התארגנות המחבלים התגבשה במסגד "אלמלסאא" באם אל פחם, בו שימש מחמד אחמד מחמד ג'בארין כאחראי ניקיון וכמואזין המסגד. ממצאי החקירה הצביעו גם על זיקה ברורה בין מסגד "אלמלסאא" לבין הפלג הצפוני של התנועה האסלאמית, אשר הוכרזה כהתאחדות בלתי מותרת ונחשבת כיום לארגון טרור.
כמו כן אותרו קשרים בין המחבלים לתנועה האיסלאמית. כך למשל אומרים בשב"כ כי מחמד אחמד מחמד ג'בארין פעל בעבר במסגרת ארגון "המראבטון", אשר הוכרז גם הוא כהתאחדות בלתי מותרת על רקע פעילות כנגד ביטחון המדינה במתחם הר הבית. עוד יצוין כי השיח ראאד צאלח, ראש התנועה האיסלאמית נשא דברים בהלוויתם הלילית של שלושת המחבלים באום אל פחם, דברים בגינם הוא נחקר בימים אלה בגין חשד להסתה.
במסגרת חקירת הפיגוע נעצר ונחקר ע״י שב״כ אמג'ד מחמד אחמד ג'בארין. בחקירתו של אמג'ד, אזרח ישראלי, תושב אום אל פחם, אשר היה מקורב למפגעים, עלה כי המפגעים שוחחו טרם הפיגוע אודות כוונתם לבצע פיגוע ירי ואף הוצע לו להצטרף אליהם לביצוע הפיגוע לפחות בשתי הזדמנויות.
כמו כן עלה בחקירה כי המפגעים הסתירו את הנשקים מסוג קארל גוסטב עימם ביצעו את הפיגוע בארון בתוך אותו מסגד "אלמלסאא".
ממצאי החקירה של אמג'ד לימדו, כי כהכנה לקראת הפיגוע ביצעו המפגעים מספר אימוני ירי בכלי הנשק שהיו ברשותם באזור הררי הסמוך לאום אל פחם, וזאת בסיועו של אמג'ד, אשר אף נטל חלק באימון הירי באחת ההזדמנויות.
אמג'ד אף סייע למפגעים והסיע אותם בליל הפיגוע מהמסגד לנקודת האיסוף לעלייה להר הבית, כאשר הם חמושים, תוך שהוא מודע לכך כי המפגעים מצויים בדרכם לבצע פיגוע. לאחר מכן אף העביר את חפצי המפגעים אשר נמסרו לו טרם הפיגוע למקום מסתור. בגין מעורבותו המשמעותית בהוצאת הפיגוע אל הפועל מיוחסות לאמג'ד בכתב האישום שהוגש כנגדו ע״י פרקליטות מחוז חיפה, בין היתר, עבירות של סיוע לרצח ופעולה בנשק למטרת טרור.
יש לציין כי יומיים לאחר הפיגוע פרסמנו בקול היהודי כתבה אודות הקשר של המחבלים למסגד המדובר, וכי המתפללים אף ערכו לזכרם תפילה מיוחדת לאחר הפיגוע.
